s*****y
发帖数: 8 | 1 rt~
总觉得主流的bioinformatic做序列啊芯片啊之类的分析，，好像不太一样。。
不知道有没有同学也在做这个方向，问问前景如何啊 。
thx~ |
N******n
发帖数: 3003 | 2 这个不算informatics, 如果你侧重方法，就好，
一般MD，postdoc都难找。
【在 s*****y 的大作中提到】
: rt~
: 总觉得主流的bioinformatic做序列啊芯片啊之类的分析，，好像不太一样。。
: 不知道有没有同学也在做这个方向，问问前景如何啊 。
: thx~
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s*****y
发帖数: 8 | 3 同觉得不算
侧重方法就好是指？
【在 N******n 的大作中提到】
: 这个不算informatics, 如果你侧重方法，就好，
: 一般MD，postdoc都难找。
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a*******n
发帖数: 156 | 4 把统计学好了，找bioinformatics也是可以的
另外去找drug design或者antibody design比较对口 |
V**3
发帖数: 12756 | 5 只有simulation 经验的，做drug design 是不可能找到工作的
至少要再会另一种 real work （合成除外， 合成精通也找不到工作）
【在 a*******n 的大作中提到】
: 把统计学好了，找bioinformatics也是可以的
: 另外去找drug design或者antibody design比较对口
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t******n
发帖数: 138 | 6 real work 是指?
【在 V**3 的大作中提到】
: 只有simulation 经验的，做drug design 是不可能找到工作的
: 至少要再会另一种 real work （合成除外， 合成精通也找不到工作）
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l*****3
发帖数: 12 | 7 有朋友 老美 不会自己编程 找工作一样困难。。。
【在 s*****y 的大作中提到】
: rt~
: 总觉得主流的bioinformatic做序列啊芯片啊之类的分析，，好像不太一样。。
: 不知道有没有同学也在做这个方向，问问前景如何啊 。
: thx~
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a*******n
发帖数: 156 | 8 如果模拟做得好，我觉得drug design的工作是可以胜任的。至于公司乱七八糟的要求
，好多时候都是看它缺不缺人。
【在 V**3 的大作中提到】
: 只有simulation 经验的，做drug design 是不可能找到工作的
: 至少要再会另一种 real work （合成除外， 合成精通也找不到工作）
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w****k
发帖数: 6244 | 9 把计算机学好
找it工作
don't waste ur time
【在 s*****y 的大作中提到】
: rt~
: 总觉得主流的bioinformatic做序列啊芯片啊之类的分析，，好像不太一样。。
: 不知道有没有同学也在做这个方向，问问前景如何啊 。
: thx~
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f**********e
发帖数: 1994 | 10 对。
俺以前就搞了一阵 MD。找工作的心得是：俺们就像撸管男去找牛郎的工作一样。
【在 w****k 的大作中提到】
: 把计算机学好
: 找it工作
: don't waste ur time
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m*k
发帖数: 245 | 11 MD做起来比较费时，而且需要大的cluster，一般的公司可能都没有。如果单纯MD的话
找academic的工作比较容易。去公司的话得结合点docking，qsar之类的能快速出结果
的东西。 |
m*****7
发帖数: 133 | 12 只做simulation的话可以考虑一下药物设计相关的工作，但好像现在这方面职位也不多。
大的化工巨头P&G, Johnson&Johnson还有IBM research它们也招做simulation的人，这
个得留心招聘信息。
如果理论功底比较深，做点方法的话，postdoc不难找的，MD是可以通吃化学生物材料
各个学科的，但看你喜不喜欢做学术了。
如果编程功底比较好，懂C++/Java之流，那其实可以找码工的工作，Bloomberg的
software developer就招有这种计算背景的Phd，某些银行，比如Capital one，据说也
招这样的人做Data Analyst。
【在 s*****y 的大作中提到】
: rt~
: 总觉得主流的bioinformatic做序列啊芯片啊之类的分析，，好像不太一样。。
: 不知道有没有同学也在做这个方向，问问前景如何啊 。
: thx~
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l**********1
发帖数: 5204 | 13 RE talisman (护身符)
MD PD or PhD backgroud
can do
post solid-state NMR analysis or SAXS or X-ray 3D structure analysis
conformation data assembly or prediction
or post STROM PALM STED optical single molecular microscope analysis
imaging assembly or prediction.
>
>>
【在 t******n 的大作中提到】
: real work 是指?
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B****m
发帖数: 63 | 14 只做MD太狭窄了吧。
我认为MD要和bioinformatics结合，甚至结合具体实验，用于解决实际问题。
比如，某疾控部门每年收集测序10万个流感病毒样本，能否对每年的数据先进行生物信
息分析然后通过MD预测和解释病毒进化的特性（比如受体结合位点和亲合力、毒力强弱
）？
比如，知道蛋白A的大概结构，也知道该蛋白与小分子药物B的大概结合区域（15个氨基
酸范围）。能否由此通过MD阐明A和B的结合详细特点，进而对药物B的结构进行修改/修
饰以提高治疗效果？
以上是我遇到的问题。我想MD结合实验和其他计算手段才能解决。如果哪位大侠知道怎
么弄，请给我指点些。 |
t******n
发帖数: 138 | 15 Thanks.
【在 l**********1 的大作中提到】
: RE talisman (护身符)
: MD PD or PhD backgroud
: can do
: post solid-state NMR analysis or SAXS or X-ray 3D structure analysis
: conformation data assembly or prediction
: or post STROM PALM STED optical single molecular microscope analysis
: imaging assembly or prediction.
: >
:
: >>
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l**********1
发帖数: 5204 | 16 De rien.
【在 t******n 的大作中提到】
: Thanks.
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s*****y
发帖数: 8 | 17 看之前的帖子。大家似乎都不持乐观态度。。有个cs的ad。。但是现在quit了phd 又没
拿master。不知道这段gap会不会对以后工作有影响。。
【在 w****k 的大作中提到】
: 把计算机学好
: 找it工作
: don't waste ur time
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s*****y
发帖数: 8 | 18 对学术感兴趣但完全不想做faculty。。
于是说注意提高编程水平也是可以做码农的么？ 所在学校是医学院，觉得在码农界应
该没有reputation的。。
多。
【在 m*****7 的大作中提到】
: 只做simulation的话可以考虑一下药物设计相关的工作，但好像现在这方面职位也不多。
: 大的化工巨头P&G, Johnson&Johnson还有IBM research它们也招做simulation的人，这
: 个得留心招聘信息。
: 如果理论功底比较深，做点方法的话，postdoc不难找的，MD是可以通吃化学生物材料
: 各个学科的，但看你喜不喜欢做学术了。
: 如果编程功底比较好，懂C++/Java之流，那其实可以找码工的工作，Bloomberg的
: software developer就招有这种计算背景的Phd，某些银行，比如Capital one，据说也
: 招这样的人做Data Analyst。
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m*k
发帖数: 245 | 19
如果蛋白A的结构已知就比较好办，如果蛋白A的某些区段的结构缺失，可以用homology
modeling补上
然后可以把小分子B放到蛋白A的binding site附近，然后运行MD，看看能不能观察到小
分子B和蛋白A的结合，和蛋白A的哪些残基相互作用，分析一下是哪种作用，比如Hbond
，aromatic stacking或者其他hydrophobic interaction，或者salt bridge什么的等
等。然后就可以有目的的优化小分子B的结构以便可以和蛋白A有更强的相互作用。这是
基于enthalpy的。更进一步，你可以用MD计算binding free energy,enthalpy-entropy
contribution,然后结合ITC实验，这样可以得到更多的信息。
【在 B****m 的大作中提到】
: 只做MD太狭窄了吧。
: 我认为MD要和bioinformatics结合，甚至结合具体实验，用于解决实际问题。
: 比如，某疾控部门每年收集测序10万个流感病毒样本，能否对每年的数据先进行生物信
: 息分析然后通过MD预测和解释病毒进化的特性（比如受体结合位点和亲合力、毒力强弱
: ）？
: 比如，知道蛋白A的大概结构，也知道该蛋白与小分子药物B的大概结合区域（15个氨基
: 酸范围）。能否由此通过MD阐明A和B的结合详细特点，进而对药物B的结构进行修改/修
: 饰以提高治疗效果？
: 以上是我遇到的问题。我想MD结合实验和其他计算手段才能解决。如果哪位大侠知道怎
: 么弄，请给我指点些。
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