l*******y 发帖数: 3987 | 1 赞倒三角!用aloe gel吧,你这还是出门度假被晒伤,偶更悲剧,在实验室切胶,被紫
外线晒伤了:( |
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c******3 发帖数: 64 | 2 推荐太内急。拉打成功率比其他都高。弹性好。但不能搓球了。不转切易冒高以你的打
法。长脚拱完就一板。要想提高。就stop 搓球。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6 |
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b********l 发帖数: 707 | 3 我只是不想单独切出眼睛的照片,这样很假,别人还以为不是一个人呢:) |
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b********l 发帖数: 707 | 4 有人找我吵架,心情好我就奉陪啊,难道我钻被窝里哭切? |
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p*e 发帖数: 6785 | 5 翻转完了,切一小块下来粘贴,再ps一下
有生之年混个院士当当。 |
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R****g 发帖数: 110 | 7 不是,我是原来DNA打碎后加的Adaptor的,然后用PE引物做了emulsion PCR,PCR产物
250bp切胶回收后又用PE引物
重新扩增。总之,用PE引物扩增的产物用E-gel和bioanalyzer检测的大小差100bp左右
。我现在想想可能是引物的问题,
原来illumina的引物我用完后就用invitrogen合成的,不知道illumina是不是把引物做
了修饰所以特别好用,或者和我自己
的引物序列都不一样。 |
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s********n 发帖数: 2939 | 8 现在全部都改用SYBR Green和GelRed了,下游的操作和用EB一样,唯一的优点就是切胶
的可以不用紫外,既保护自己也保护DNA,但我都是严格按照EB的防护处理的,毕竟能
够和DNA结合的dyes,估计突变毒性不会小。 |
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y*******w 发帖数: 5917 | 9 SB楼主,莫非是唐俊亲友团?楼主这篇“打假”文章有几个硬伤,
1。Michigan State Univ虽说不是什么非常大的名校,但是至少可以算作二流,
2。JBC虽然每年文章量很大,但是基本上算是很严肃的杂志,
3。在过去切胶然后放在一起拍照是比较正常的,过去实验仪器一般,做个现在看似简单的试验需要很长时间。没有什么kit,经常发生control和试验结果并非同时结束的情况。
4。仔细观察的话,可以发现切割线其实并非完全垂直,如果是PS的话,何必搞一个非垂直的切割线? |
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d*********n 发帖数: 10 | 10 强烈建议用 MO BIO Laboratories, Inc的UltraClean DNA purification Kit (Cat #
= 12100-300). 自从我摒弃QIAGEN的Kit,改用MO BIO的Kit以后,胶回收片段的回收率
一直很高很稳定(很强大)。我们实验室现在都在用这个KIT.
GOOD LUCK! |
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m*********s 发帖数: 1188 | 11 让俺先去学点东西才能看懂各位牛人的发言....
native gel electrophoreis,切胶回收...
mono S, mono Q,
谢谢. 做功课去先.. |
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O******e 发帖数: 4845 | 15 不用这么担心,就当是在外面晒了一下午太阳好了。
不过以后还是要穿长袖才好。一下子40个constructs,够疯狂的。 |
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o**4 发帖数: 35028 | 16 戴手套、穿长袖就行了,
照一次肯定没啥事的,不要常干这种事就好 |
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v***a 发帖数: 1242 | 18 回家用冰牛奶冷敷,牛奶越冰,敷的时间越久越好
我有一次还倒霉,当时太投入,并且也戴防护镜的,结果晚上回家roommate问我脸怎么
了,这么红。。。我晕死,着急得一晚上没睡好觉
第二天才用冰牛奶敷的,后来脸就黑了,再然后没感觉有什么异常,脸色也早已恢复。
不放心的话也可以去超市买点治晒伤的药。 |
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a*******e 发帖数: 245 | 19 我戴透明面罩,可惜这次穿的体恤,也忘了穿试验服了
thanks all again! |
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c******r 发帖数: 3778 | 20 哈哈,紫外线嘛,用sunscreen吧,不是有spf 70的吗?应该99.99%的紫外线都被block
掉了。 |
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s******s 发帖数: 13035 | 21 我有一次晚上做实验,第二天上课上的一半发现眼前渐渐模糊,
后来基本是半瞎,休息了半天才回复 |
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n***w 发帖数: 2405 | 23 嗯,我今天把pfu和taq混一起跑了,跑出来了。然后切胶回收了。
谢谢。
的? |
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i***a 发帖数: 11095 | 24 切胶纯化后的PCR产物作为模板的话,本来就很难成功
若是还不熟练的话,建议先将PCR产物先链接到现有的easy vector中扩增后
作为模板试试 |
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D*a 发帖数: 6830 | 25 想做个nest PCR,但是在heterozygote 上面做,所以要切胶。。。
不过不需要很纯化的dna,实验室也没有kit或者各种相应工具,请问最简单的把几个
dna分子弄出来的方法是什么?够个pcr的就行了。多谢~ |
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s******r 发帖数: 2876 | 26 放到-20冻起来,然后融化,高速离心,取上清试试。
想做个nest PCR,但是在heterozygote 上面做,所以要切胶。。。
不过不需要很纯化的dna,实验室也没有kit或者各种相应工具,请问最简单的把几个
dna分子弄出来的方法是什么?够个pcr的就行了。多谢~ |
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w*****n 发帖数: 310 | 27 应该挺简单的,照这个配下buffer https://products.appliedbiosystems.com/ab/en/
US/adirect/ab?cmd=catNavigate2&catID=603425 sample 95度3-5分钟,不用30分钟,
那是给大片段用的,200以下SSR之类的5分钟就够了,时间太长了引起降解(大片段掉俩bp
看不出来),确实会出N条带,冰上放一会儿(把泳道吹干净了),尥蹶子跑吧.然后染色,切
胶回收,(一条30bp,一条40bp是很大的差异了,一般差2bp就可以保证质量了)。 |
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V********n 发帖数: 305 | 28 LZ最终目的不是要visualize band,然后切胶做mass spec.么?不是WB吧。pierce kit
似乎是WB用的。俺记得invitrogen有kit可以只洗脱蛋白,而不release antibody |
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k****l 发帖数: 279 | 29 理论上可以,但是难度比较大,主要是从胶里提取一般不纯,有agarose |
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f****n 发帖数: 114 | 31 我用的切胶回收 然后QIAquick Gel Extraction Kit |
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j****x 发帖数: 1704 | 32 一般公司都可以提供rational antigen design的服务,从序列中特征性选取多肽片段
然后交联到BSA等载体蛋白上再制备单抗或多抗。如果目标蛋白是有三级结构信息的,
这种表位预测+多肽免疫的成功率很高,一般在70%-80%以上。即便没有高级结构信息,
有经验的设计分析人员也可以将成功率控制在50%左右,一般而言选取2-3条多肽序列就
能至少有一个能制备出不错的抗体。我们这里有core facility专门提供这种服务,这
个技术本身应该说很成熟了。
自己原核表达纯化蛋白的部分片段自然也是一个选择,以前大部分人都不纯化而只是切
胶直接免疫,取决于你要做什么样的staining了,要求抗体特异性好的,就不建议这么
做了,光做western的话还凑合。 |
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c****1 发帖数: 1095 | 33 没有做过,但是可以考虑这个策略:
用已知的这个序列做EMSA(non-radioactive),然后切胶,mass-spec. |
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s******s 发帖数: 13035 | 34 我都说了。这种东西太脏,拿去测出几十上百个蛋白你也不知道哪个是真的。
必须有好的control,然后并排SDS-PAGE,切胶去测 |
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f*********e 发帖数: 1144 | 35 我觉得兴趣是必备条件,但是远远不够资质的要求。资质应该至少具备,
1.是不是比大多数人聪明,比如你中学学理科的时候是不是不用上课,随便翻翻书,就
可以考高分。我很佩服原来高中版上一个女生,每天上课下课画漫画,但是竞赛总是最好
2.有没有宏观的调控能力,这个不是解个方程,我也不知道怎么阐述,言语太贫乏
3.又有敏锐的观察,对于微观的重要疑点一点也不放过
4.最初开始怎么也需要很好的动手能力吧,至少不能像我一样,作western都不敢切胶
,或者把焦片全部曝光。。。 |
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a*******a 发帖数: 4233 | 36 拿0.几ul产物太多了,0.几ul搞不好ug级别的模板
纯化一下稀释1000倍至10万倍做个梯度试试。
我们pcr有杂带以后切胶纯化目的片段重新pcr没问题的
goodluck |
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t*****z 发帖数: 1598 | 37 谢谢各位的提议!这两天我又做了一系列实验,试图提高两边都是原始引物的情况的扩
增效率,同时也做了几组一边原始一边巢式的。我目前发现:延长失活初始时间没用(
我原先设想长时间高温可以破坏DNA末端的二级结构);延长延伸时间没用;增加模板
量有用(条带变深了);增加反应循环数没用;降低温度没用(用的温度都高于理论Tm
);增加镁离子没用(反而增加非特异扩增),改变缓冲液的种类没用(比如用Cl和用
SO4的)。我打算试试直接纯化和切胶回收。
大家的提议,我会陆续试试看! |
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j****t 发帖数: 1663 | 38 我得到过和你差不多的size,有时略大些,average size is 300-350bp
因为上sequencer之前要作size selection (切胶纯化,200-400bp左右),所以我觉
得把DNA打到300bp左右应该还是可以测序的。
你不放心的话,可以先找个positive control region 来测一下你的ChIP DNA.再上
sequencer |
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j****t 发帖数: 1663 | 39 我得到过和你差不多的size,有时略大些,average size is 300-350bp
因为上sequencer之前要作size selection (切胶纯化,200-400bp左右),所以我觉
得把DNA打到300bp左右应该还是可以测序的。
你不放心的话,可以先找个positive control region 来测一下你的ChIP DNA.再上
sequencer |
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l*****i 发帖数: 1163 | 41 我自己的:从液氮罐取细胞时爆炸,鼻子破了,去医院包扎,很大一托。掰针药瓶的时
候玻璃扎破手,被老鼠咬,被针头戳
有个师弟拿了支细胞,说是炸弹,往水里一扔,结果真炸了。
有个师妹切胶时被紫外烧伤眼睛
要把一个大摇细菌的屋子改为办公室,用甲醛熏,结果墙壁有条缝,透到旁边实验室来
了。一个来面试的学生正在那里看文献。。。。。。后来老板收了她。
细胞间里的有紫外,有一次忘了关,把三做实验的照了半小时。有个师兄在Hood里忘了
关紫外,把细胞杀死了,结果还据此发了篇文章。
在Hood里点酒精灯,把酒精灯打翻了,酒精把整个Hood烧废了。从此灭火器成标配。 |
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l***g 发帖数: 19 | 42 想先做GST-pulldown,然后用pulldown产物电泳银染切胶回收去做MS。问题是,如果我
现在想用细菌中纯化的GST融合蛋白,应该bind多少蛋白到多少的beads上(100ul?)
,然后用HeLa细胞的裂解液来亲和吸附,应该大概用多少HeLa细胞裂解液?我感觉细胞
裂解液少了的话可能结合在GST融合蛋白上的蛋白太少了,在之后洗脱的过程中可能又
损失点,然后在银染的话可能看不出来。如果不用裂解液用动物组织,譬如rat或者
sheep的脑子,大概需要裂解多少克的脑子?多谢! |
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d*******j 发帖数: 64 | 43 在你的一个引物5‘端加上M13序列,pcr后不要切胶回收,做个cleanup或者直接拿去测
序,测序引物用M13。
off
Qiagen |
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D******9 发帖数: 2665 | 45 请教一下, 我想做一个endogenous IP, 然后跑SDS-PAGE , coomassie blue染色后切
胶, 做MASS。
这个蛋白表达量不高, 需要用很多cells 然后IP, 估计得combine好几个IP后才能看
到带, 我用SDS-loading buffer 煮protein-antibody complex, 但是这样体积就太
大了, 没法load 到一个well, 有啥好办法解决这个问题? 谢谢。 |
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y******g 发帖数: 3 | 46 小弟目前在做关于lncRNA的研究,在做race鉴定一些lncRNA的全长。遇到了一些问题。
求助各位高手。
我用目前的方法做出了2条全长以后,接下来怎么做都做不出来了。
我RACE完的产物每一次都能跑出很亮的1-1.5KB的条带,切胶回收连接到T载体以后测序
。发现序列都是错的,序列两端有制作模板时候加的接头序列,但是中间的片段在基因
组里都找不到,或是一些错的片段。我自己检查了引物,酶,DNTP,水都没有污染,也
不知道为什么会这样,求高手指点. |
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q*******8 发帖数: 768 | 47 上样太多了吧。。。我做切胶回收的时候都是这个样子的。。。。。。 |
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w********a 发帖数: 324 | 48 搭车问一个PCR的问题:
我用做完的PCR product,作为template,继续做PCR
,想得到更高浓度的产物;但总是不成功。要么干脆没有条带,要么有比较强的
unspecific的杂带。不知道您有什么好的建议。。
我试过用做完PCR的mixture直接作为template,也试过先clean-up一下,或者切胶纯化
一下,都不成功。不知道为什么?
非常感谢。
Scar
assembly
exonuclease |
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k****l 发帖数: 279 | 50 片段切胶纯化了吗?
连起来之后就能表达吗?如果是,怕蛋白对细菌有毒性 |
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