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全部话题 - 话题: plasmids
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M******t
发帖数: 555
1
digest 100ug plasmid DNA 最小体积多少啊?
谢谢.
w**u
发帖数: 311
2
各位XDJM,借人气问一问题
我一朋友半年前海归,留了两盒质粒让我保存。现来电让我用他的FEDEX帐号寄回去。
不知道出入海关会有限制和麻烦吗?各位有无经验如何填FEDEX的“shipment
information"栏
我如下填写:
Commodity Description:Plasmids in dry ice
Harmonied Code: 不知怎么写
Country of Manufacture: USA
Value of Customs: N/A
自己很想帮忙,但也不想给他或我带来麻烦。
请前辈们指教
C*******e
发帖数: 4348
3
就是plasmid的话不是提出来然后点在filter paper小片片上寄回去会容易点嘛?
对海关来说就是纸片片而已
M*****n
发帖数: 16729
4
点在filter paper上面,fedex overnight
除非是巨大的plasmid, 一般都没问题。
w**u
发帖数: 311
5
That means I probably have to make spot 200 plasmids one by one on filter
paper.
Are there other ways?
M**a
发帖数: 4816
6
Just go with Fedex, no need to mention about plasmids nor dry ice (even you
have dry ice in the box).
You can indicate it as medical supplies.
c***c
发帖数: 113
7
来自主题: Biology版 - plasmid序列分析软件
请教大牛,有什么好用功能又全的plasmid序列分析软件可以推荐, PC上用的。
谢谢
a****d
发帖数: 1919
8
来自主题: Biology版 - plasmid序列分析软件
a plasmid editor
http://biologylabs.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/
user friendly and free!
S******e
发帖数: 393
9
来自主题: Biology版 - 大的plasmid是不是不好转染?
很佩服,我转的plasmid和LZ大小差不多,也一直存在困难。
还没用过Fugene6,下次试试,就按公司提供的protocol吗?
你转的什么细胞?表达高么?
e***o
发帖数: 344
10
问个很土的问题,转染时,带有一种ori的质粒只会有一个copy在一个细菌里。也就是
plasmid incompatibility。google了一下,好象没有得到很专业的回答。大家有清楚
这个的吗? 谢谢!
s******s
发帖数: 13035
11
yes. 要用质量很好的plasmid
W**S
发帖数: 275
12
我也是奇怪在这呢,就算TITER低也不至于一点没有。PLASMID用RE DIGESTION CHECK了
,有INSERT, 是PLKO-TET-ON LENTIVIRUS SHRNA construct, 用STBL2转的,不至于丢
了PURO啊。
r******y
发帖数: 21907
13
是不是plasmid太长了,还是最好先到TA vector里再克隆到 gateway?
g*********5
发帖数: 2533
14
来自主题: Biology版 - 谁有pQC-XIX plasmid?
like me ask some lentivirus vector to overexpess,
because no commercial availlable now.
some ppl have this plasmid,
i wrote to him, but not reply...
I bought vetor from invitrogen, no work :(
g*********5
发帖数: 2533
15
HARVARD seems have a bank of plasmid.I can't remember.
also, try this one.
http://psimr.asu.edu/about.html
u***e
发帖数: 71
16
请问高人,有没有什么办法在一个22kb的plasmid中特定位置插入30 bp的序列?谢谢
a****d
发帖数: 1919
17
Two step PCR should work for your propose.
synthesize two pair of primers:
F1-xxxx
30bp-xxxx-R1
F2-xxx-30bp
xxxx-R2
PCR separately, then put together both products as template, PCR again using
F1-xxxx and xxx-R2. The final PCR product could be subcloned into the
plasmid. You have to find the suitable digestion sites when designing
primers though.
n********k
发帖数: 2818
18
Recombination/gateway cloning would be the way to go, very easy if you know
the system, check liu pengtao's work...
For traditional cloning, Sunny's suggestion is the way to go... very easy
too if one is experienced with the MB and the 22kb plasmid itself is not
weird...try to have the insert size about 100-500bp...size in this range are
easier to handle than longer or shorter ones in general...
n********k
发帖数: 2818
19
never did cloning this way myself...but I advised my former roommate to
develop the tech and I remembered he inserted three LoxP sites into a 25kb
or so plasmid within literally 2-3 weeks...I could be wrong since I was not
the one doing it...but I thought the concept was simple: u have the homology
adapters flanking the sequence of interests...someone say 30 bp may be too
small and could get lost...never did myself, don't know(maybe I shouldn't
have commented so surely:)))...I could ask my form... 阅读全帖
s*********t
发帖数: 600
20
是吗?多谢
不过我看到有人说mini的plasmid的quality较差,因为没有去掉内毒素,有较多开环和线性,而maxi的去除了内毒素,且
多为超螺旋,更适合转细胞
还有G418和puro该怎么保存?
s*********t
发帖数: 600
21
谢了。
不过不是担心plasmid的量,而是担心质量
有时候只转很少的细胞,mini prep的量是够的,做max太麻烦
想知道mini的到底能否转染细胞

but
s******r
发帖数: 2876
22
这个depend on你的细胞,如果你的细胞耐粗饲,那没问题。
试一下好了。

谢了。
不过不是担心plasmid的量,而是担心质量
有时候只转很少的细胞,mini prep的量是够的,做max太麻烦
想知道mini的到底能否转染细胞
but
g*********3
发帖数: 177
23
如果你担心的不是mini prep的DNA quantity,那么mini prep是可以的。mini prep的
kit也有好几种,你可以选哪种transfection grade的,没有问题。
http://www.qiagen.com/products/plasmid/qiagenplasmidpurificatio
我以前用过,但不知道是不是这个kit。
z*****6
发帖数: 14
24
Does anybody has AdEasier®-1 cells (BJ5183 contain the AdEasy®-1
plasmid)? Thanks.
w**t
发帖数: 52
25
来自主题: Biology版 - 酵母转化plasmid copy number
Are you going to do Y2H screening? If so, only those interact could grow on
selective plates (SCM-L-T-H). You could further purify your candidates by streaking before you recover the
plasmids.
T****i
发帖数: 15191
26
还有STRE-lacZ reporter plasmid, 介绍一下,或请给个reference。拜谢了。
p****e
发帖数: 105
27
来自主题: Biology版 - 可以写信问别人要plasmid吗?
看到paper构建了一个plasmid表达蛋白,可以写信要吗?不是很复杂的东西,只是我不
是学生物的,自己不会。
s***m
发帖数: 6197
28
来自主题: Biology版 - 求TurboTEV plasmid
版上有谁实验室里有表达TurboTEV的plasmid
如果有的话能不能给送一些(站内信件联系或者发邮件到x****[email protected])
最近做的一个蛋白需要把tag切掉,用的量比较多,想自己表达
谢了先!
C***Y
发帖数: 142
29
来自主题: Biology版 - 求 sigma-1 receptor plasmid
如果哪位大侠有sigma-1 receptor plasmid, 敬请站内PM我。最近需要overexpress
sigma-1 receptor. 万分感谢!!!
m******t
发帖数: 109
30
来自主题: Biology版 - PLASMID 问题
我把GOI 插入到一个带GFP的空载体里面,结果发现不绿,而同时转的原来的 空载体还
是绿的。PLASMID 是SEQUENCE过的。求教了
m******t
发帖数: 109
31
来自主题: Biology版 - PLASMID 问题
其实是绿的,非常弱。
现在的问题是, 我自己做的PLASMID有的绿, 有的不绿。请问是和原因。
n****y
发帖数: 819
32
来自主题: Biology版 - 求推荐 cloning plasmid
需要一个很简单的 cloning plasmid, 必须要有 KpnI 和 XhoI, 不能有 AvrII。 只
是用来做cloning 的, 不需要表达, 所以其他elements越少越好, 而且千万不能有
sv40 early promoter and origin, 因为里面有一个酶切位点之后会用到。 谢谢
W*******n
发帖数: 2762
33
想把plasmid extract, 但怎么把genomic DNA去掉?
s******s
发帖数: 13035
34
stable line里面的Plasmid都整合了,你有提取的功夫都可以自己做一个了
m*****r
发帖数: 1164
35
来自主题: Biology版 - Vacuum manifold for 96-well plasmid prep
Is there anybody has experience with 96-plasmid prep? I'm looking for the
vacuum manifold. The Axygen one does not work well. Thanks a lot. Cannot
type Chinese on this computer.
D***a
发帖数: 516
36
来自主题: Biology版 - 体内直接注射plasmid?
刚看了一篇新的nature medicine的文章,有一个实验直接把luciferase基因的plasmid
注射到皮下,20天后还能检测到luciferase activity。很好奇,google了一下,还真
有别的文章也这么直接注射。这种实验可信吗?
A******y
发帖数: 2041
37
来自主题: Biology版 - 体内直接注射plasmid?
That's the trick isn't it. I guess that's why it is in Nature Medicine for
stabilizing the plasmid.
C*******e
发帖数: 4348
38
rt
有没有人用QuikChange Mutagenesis PCR protocol做过8 kb plasmid?
以前小质粒,4、5 kb的都没什么问题,换碱基、插入、去除什么都行
这次一个8kb的,一共只要替换6个碱基,怎么做都出不来条带
试过优化条件,不同模板浓度,不同PCR条件,加reagent去除2级结构什么的
是不是8kb太长了?
s*******m
发帖数: 24
39
Try 3min/kb extension time. Worked for >10kb plasmids for me every time.
Also double check your primers...
X******n
发帖数: 914
40
你的plasmid是Sp resistant为什么不能用TOP10?
u*********1
发帖数: 2518
41
我正好在做这个,8kb的plasmid,用Pfu貌似没问题,PCR出一堆smear,然后digestion
,transformation
但我接着这里也有俩问题:
1. 从板子上挑选不同的colony摇菌,提质粒,测序,发现有的成功引入突变,有的没
有引入突变,有的甚至出现其他地方(不应该出现的)什么deletion之类的。。
这如何解释呢
2. 8kb的target of interest大概是2.5kb;我现在是设计10对引物覆盖这2.5kb,等于
把整个2.5kb都测一下。。。需要这么做吗?因为虽然大家说Pfu很高保真,但我依然害
怕引入其他的乱七八糟的东西,毕竟PCR的产物是一堆smear。。。其实我都好奇这种
long-range PCR到底发生了什么。。。
s********n
发帖数: 2939
42
来自主题: Biology版 - how to amplify miniprep plasmid DNA?
Transform cloning strain by your extracted plasmid from mini scale and then
large scale
w********r
发帖数: 1431
43
来自主题: Biology版 - how to amplify miniprep plasmid DNA?
just re-transform your low conc. miniprep plasmid

the
b**********8
发帖数: 349
44
如题,人在国内,没有fedex账号(我知道考验我人品的时候到了),请问谁有MISSION
® TRC2 pLKO.5-puro Non-Mammalian shRNA Control Plasmid DNA(产品编号
SHC202)这个质粒?Sigma官网这个质粒要4000多,太贵了,哪位好心人愿意馈赠一点?
如果不方便走fedex(如果有收货方付款的话更好了),选择普通邮寄也可。非常感谢
z*******9
发帖数: 112
45
来自主题: Biology版 - QIAGEN Plasmid Plus Maxi Kit 疑问
今天实验室打扫,不知从哪个犄角旮旯里翻出一个几乎没用的QIAGEN Plasmid Plus
Maxi Kit,看了看他的简介,貌似真够省时间的,我也想试试,
有没有用过的同修可以科普一下他的坏处,或者要注意的,
谢谢
f*****r
发帖数: 84
46
来自主题: Biology版 - 如何去除plasmid prep里的gDNA
要做一个screen 然后sequence plasmid library. 所以小含量的gDNA 会比较影响结果
。 大家有什么比较好的方法除去gDNA 么。 是不是大片段dna 在cartridge 上elute
就不容易, 这样我再做一个pcr clean up 是不是gDNA 会去掉很多。
thanks!
f*****r
发帖数: 84
47
来自主题: Biology版 - 如何去除plasmid prep里的gDNA
似乎有plasmid safe exonuclease 看来可以试一下。 Thanks!
f*****r
发帖数: 84
48
来自主题: Biology版 - 如何去除plasmid prep里的gDNA
似乎有plasmid safe exonuclease 看来可以试一下。 Thanks!
f*****r
发帖数: 84
49
来自主题: Biology版 - 如何去除plasmid prep里的gDNA
似乎有plasmid safe exonuclease 看来可以试一下。 Thanks!
m*********D
发帖数: 1727
50
来自主题: Biology版 - 如何去除plasmid prep里的gDNA
考虑一下比较老的方法:Traditional Methods for CsCl Isolation
of Plasmid DNA by Ultracentrifugation
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